Juan Manuel Pedraza Leal

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Juan Manuel Pedraza Leal

Juan Manuel Pedraza Leal

jmpedraza @uniandes.edu.co

Profesor Asociado

Office: IP-404

Extension: 5179

Departamento de Física

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Recent Courses

  • 2025
    • PROYECTO EXPERIMENTAL

      First period
      Bachelor Level

      BIOFISICA (MEDI)

      First period
      Bachelor Level

Recent Products

.(2024). A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny.
A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny
Thesis
.(2024). Altruism and cooperation in plasmids: an initial experimental approach.
Altruism and cooperation in plasmids: an initial experimental approach
Thesis

Recent Projects

  • 2011
    • STOCHASTICITY AND GROWTH EFFECTS ON BACTERIAL PERSISTENCE

      Duration: 36 months

      PR.3.2011.1513.jmpedraza

Courses

  • 2025
    • PROYECTO EXPERIMENTAL

      First period
      Bachelor Level

      BIOFISICA (MEDI)

      First period
      Bachelor Level
    • PROYECTO TEORICO COMPUTACIONAL

      First period
      Bachelor Level

      PROYECTO FINAL

      First period
      Bachelor Level
  • 2024
    • PROYECTO EXPERIMENTAL

      Second period
      Bachelor Level

      PROYECTO FINAL

      Second period
      Bachelor Level
    • FÍSICA BÁSICA 2

      First period
      Bachelor Level

      PROYECTO FINAL

      First period
      Bachelor Level
    • BIOLOGIA DE SISTEMAS

      Second period
      Bachelor Level

      PROYECTO TEORICO COMPUTACIONAL

      Second period
      Bachelor Level
    • BIOLOGÍA DE SISTEMAS

      Second period
      Master Level

      PROYECTO TEORICO COMPUTACIONAL

      First period
      Bachelor Level
    • PROYECTO EXPERIMENTAL

      First period
      Bachelor Level

      FÍSICA BÁSICA 1

      Second period
      Bachelor Level
  • 2023
    • PROYECTO FINAL

      First period
      Bachelor Level

      FÍSICA BÁSICA 1

      First period
      Bachelor Level
    • FÍSICA BÁSICA 1

      Second period
      Bachelor Level

      BIOLOGIA DE SISTEMAS

      Second period
      Bachelor Level
    • BIOLOGÍA DE SISTEMAS

      Second period
      Master Level

      PROYECTO TEORICO COMPUTACIONAL

      Second period
      Bachelor Level
    • PROYECTO EXPERIMENTAL

      Second period
      Bachelor Level

      PROYECTO FINAL

      Second period
      Bachelor Level
  • 2022
    • FÍSICA ESTADÍSTICA

      First period
      Bachelor Level

      BIOLOGIA DE SISTEMAS

      Second period
      Bachelor Level
    • BIOLOGÍA DE SISTEMAS

      Second period
      Master Level

      FÍSICA ESTADÍST. (REF. 202020)

      First period
      Bachelor Level
    • FÍSICA BÁSICA 2

      First period
      Bachelor Level

      NO COMA CUENTO

      Second period
      Bachelor Level
  • 2021
    • FÍSICA BÁSICA 1

      First period
      Bachelor Level

      FÍSICA ESTADÍST. (REF. 202020)

      First period
      Bachelor Level
    • NO COMA CUENTO

      Second period
      Bachelor Level

      FÍSICA ESTADÍSTICA

      First period
      Bachelor Level
    • BIOINFORMATICA

      Second period
      Master Level

      BIOLOGIA DE SISTEMAS

      Second period
      Bachelor Level
    • SEMINARIO 2 DE BIOFÍSICA

      Second period
      Master Level

      SEMINARIO 1 DE BIOFÍSICA

      Second period
      Master Level
    • BIOLOGÍA DE SISTEMAS

      Second period
      Master Level

      SEMINARIO DE BIOFÍSICA

      Second period
      Bachelor Level
  • 2020
    • INTRODUCCIÓN A FÍSICA

      First period
      Bachelor Level

      FÍSICA BÁSICA 1

      First period
      Bachelor Level
    • FÍSICA ESTADÍSTICA

      First period
      Bachelor Level

      BIOINFORMATICA

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      Master Level
    • FÍSICA BÁSICA 1

      Second period
      Bachelor Level

      PROYECTO TEÓRICO/COMPUTACIONAL

      Second period
      Bachelor Level
    • SEMINARIO DE BIOFÍSICA

      Second period
      Bachelor Level

      SEMINARIO 2 DE BIOFÍSICA

      Second period
      Master Level
    • SEMINARIO 1 DE BIOFÍSICA

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  • 2019
    • FÍSICA BÁSICA 1

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      BIOLOGÍA DE SISTEMAS

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    • BIOINFORMATICA

      Second period
      Master Level

      MECANICA ESTADISTICA

      First period
      Master Level
    • FÍSICA BÁSICA 1

      Second period
      Bachelor Level

      INTRODUCCION A FISICA

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      Bachelor Level
    • BIOLOGIA DE SISTEMAS

      Second period
      Bachelor Level

      COLOQUIO 2 DE FISICA

      Second period
      Bachelor Level
    • COLOQUIO 1 DE FISICA

      Second period
      Bachelor Level
  • 2018
    • BIOINFORMATICA

      Second period
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      FISICA BASICA 1

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    • BIOLOGÍA DE SISTEMAS

      Second period
      Master Level

      BIOLOGIA DE SISTEMAS

      Second period
      Bachelor Level
  • 2017
    • FISICA BASICA 1

      First period
      Bachelor Level

      BIOLOGIA SINTETICA

      First period
      Master Level
    • BIOLOGIA SINTETICA

      First period
      Bachelor Level

      INTRODUCCION A FISICA

      Second period
      Bachelor Level
    • FISICA BASICA 1

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      MECANICA ESTADISTICA

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      Master Level
  • 2016
    • SEMINARIO DE BIOFISICA

      First period
      Bachelor Level

      FISICA BASICA 1

      First period
      Bachelor Level
    • SEMINARIO 2 DE BIOFISICA

      First period
      Master Level

      SEMINARIO AVANZADO 6

      First period
      Doctoral Level
    • CURSO DIRIGIDO II

      First period
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      SEMINARIO AVANZADO 4

      First period
      Doctoral Level
    • EXAMEN DE CANDIDATURA

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      TESIS

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS I

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      TESIS VI

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    • SEMINARIO 1 DE BIOFISICA

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      TESIS III

      First period
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    • TESIS IV

      First period
      Doctoral Level

      SUSTENTACIÓN DE TESIS

      First period
      Doctoral Level
    • MECANICA ESTADISTICA

      First period
      Master Level

      INSCRIPCION A GRADO

      First period
      Master Level
    • SEMINARIO AVANZADO 1

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      Doctoral Level

      SEMINARIO AVANZADO 5

      First period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 7

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      Doctoral Level

      INVESTIGACION 1

      First period
      Doctoral Level
    • TRABAJO DE GRADO (1)

      First period
      Master Level

      TRABAJO DE GRADO (2)

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      Master Level
    • SEMINARIO AVANZADO 3

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      Doctoral Level

      SEMINARIO AVANZADO 9

      First period
      Doctoral Level
    • INVESTIGACION 2

      First period
      Doctoral Level

      PASANTIA

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS II

      First period
      Doctoral Level

      CURSO DIRIGIDO I

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS V

      First period
      Doctoral Level

      PASANTIA II

      First period
      Doctoral Level
    • BIOINFORMATICA

      First period
      Master Level

      SEMINARIO AVANZADO 2

      First period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 8

      First period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CONOCIMIENTOS

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS VII

      First period
      Doctoral Level

      SEMINARIO AVANZADO 8

      Second period
      Doctoral Level
    • CURSO DIRIGIDO II

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTIA II

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS VI

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS VII

      Second period
      Doctoral Level
    • PASANTIA III

      Second period
      Doctoral Level

      SEMINARIO AVANZADO 5

      Second period
      Doctoral Level
    • INVESTIGACION 2

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS V

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 3

      Second period
      Doctoral Level

      CURSO DIRIGIDO I

      Second period
      Doctoral Level
    • PASANTIA

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS IV

      Second period
      Doctoral Level
    • SUSTENTACIÓN DE TESIS

      Second period
      Doctoral Level

      FISICA BASICA 1

      Second period
      Bachelor Level
    • TRABAJO DE GRADO (1)

      Second period
      Master Level

      TRABAJO DE GRADO (2)

      Second period
      Master Level
    • SEMINARIO 2 DE BIOFISICA

      Second period
      Master Level

      SEMINARIO AVANZADO 2

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 4

      Second period
      Doctoral Level

      SEMINARIO AVANZADO 6

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 7

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CONOCIMIENTOS

      Second period
      Doctoral Level
    • EXAMEN DE CANDIDATURA

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS I

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS II

      Second period
      Doctoral Level

      CURSO TUTORIAL I

      Second period
      Master Level
    • BIOLOGÍA DE SISTEMAS

      First period
      Master Level

      INTRODUCCION A FISICA

      Second period
      Bachelor Level
    • SEMINARIO 1 DE BIOFISICA

      Second period
      Master Level

      SEMINARIO AVANZADO 9

      Second period
      Doctoral Level
    • INVESTIGACION 1

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS III

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO DE BIOFISICA

      Second period
      Bachelor Level

      SEMINARIO AVANZADO 1

      Second period
      Doctoral Level
    • BIOINFORMATICA

      Second period
      Master Level

      BIOLOGIA DE SISTEMAS

      First period
      Bachelor Level
    • MECANICA

      Second period
      Bachelor Level

      PASANTIA IV

      Second period
      Doctoral Level
    • INTRODUCCION A FISICA

      First period
      Bachelor Level
  • 2015
    • COLOQUIO 1 DE FISICA

      First period
      Bachelor Level

      COLOQUIO 2 DE FISICA

      First period
      Bachelor Level
    • TRABAJO DE GRADO (2)

      First period
      Master Level

      SEMINARIO AVANZADO 3

      First period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 6

      First period
      Doctoral Level

      CURSO DIRIGIDO I

      First period
      Doctoral Level
    • CURSO DIRIGIDO II

      First period
      Doctoral Level

      PASANTIA

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS I

      First period
      Doctoral Level

      TESIS IV

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS V

      First period
      Doctoral Level

      INVESTIGACION 2

      First period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 9

      First period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CONOCIMIENTOS

      First period
      Doctoral Level
    • INVESTIGACION 1

      First period
      Doctoral Level

      SEMINARIO AVANZADO 1

      First period
      Doctoral Level
    • BIOLOGIA SINTETICA

      First period
      Master Level

      TESIS II

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS VII

      First period
      Doctoral Level

      INSCRIPCION A GRADO

      First period
      Master Level
    • TRABAJO DE GRADO (1)

      First period
      Master Level

      SEMINARIO AVANZADO 2

      First period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 4

      First period
      Doctoral Level

      SEMINARIO AVANZADO 5

      First period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 8

      First period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CANDIDATURA

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS III

      First period
      Doctoral Level

      TESIS VI

      First period
      Doctoral Level
    • SUSTENTACIÓN DE TESIS

      First period
      Doctoral Level

      FISICA BASICA 1

      First period
      Bachelor Level
    • TESIS VI

      Second period
      Doctoral Level

      SEMINARIO AVANZADO 7

      First period
      Doctoral Level
    • BIOINFORMATICA

      Second period
      Master Level

      SEMINARIO AVANZADO 4

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 6

      Second period
      Doctoral Level

      SEMINARIO AVANZADO 8

      Second period
      Doctoral Level
    • BIOLOGIA SINTETICA

      First period
      Bachelor Level

      MECANICA ESTADISTICA

      Second period
      Master Level
    • TRABAJO DE GRADO (1)

      Second period
      Master Level

      INSCRIPCION A GRADO

      Second period
      Master Level
    • FISICA BASICA 1

      Second period
      Bachelor Level

      TESIS II

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 2

      Second period
      Doctoral Level

      SEMINARIO AVANZADO 5

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 9

      Second period
      Doctoral Level

      CURSO DIRIGIDO II

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS III

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS IV

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 3

      Second period
      Doctoral Level

      SEMINARIO AVANZADO 7

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS

      Second period
      Doctoral Level

      SUSTENTACIÓN DE TESIS

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS V

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CONOCIMIENTOS

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO 2 DE BIOFISICA

      Second period
      Master Level

      EXAMEN DE CANDIDATURA

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO AVANZADO 1

      Second period
      Doctoral Level

      TRABAJO DE GRADO (2)

      Second period
      Master Level
    • PASANTIA II

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTIA

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO DE BIOFISICA

      Second period
      Bachelor Level

      TESIS I

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMINARIO 1 DE BIOFISICA

      Second period
      Master Level

      INVESTIGACION 1

      Second period
      Doctoral Level
    • INVESTIGACION 2

      Second period
      Doctoral Level

      CURSO DIRIGIDO I

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS VII

      Second period
      Doctoral Level

Products

.(2024). A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny.
A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny
Thesis
.(2024). Altruism and cooperation in plasmids: an initial experimental approach.
Altruism and cooperation in plasmids: an initial experimental approach
Thesis
.(2024). Análisis del coste metabólico y de la transmisión de información en bucles feedforward en redes de transcripción.
Análisis del coste metabólico y de la transmisión de información en bucles feedforward en redes de transcripción
Thesis
.(2024). Caracterización del ruido en redes de expresión génica en cascada.
Caracterización del ruido en redes de expresión génica en cascada
Thesis
.(2024). Caracterización fenomenológica de la propagación del ruido genético a través de cascadas transcripcionales cortas..
Caracterización fenomenológica de la propagación del ruido genético a través de cascadas transcripcionales cortas.
Thesis
Johenis Del Carmen De La Cruz Chavez, Pedraza J, Husserl J. (2024)
In-Vitro multiparametric analysis of imipenem resistance in Bacteria caused by acquisition of foreign DNA and natural mutations
Journal of Environmental Chemical Engineering (ISSN 22133437)
Article
.(2024). La relevancia del modelo de piedra, papel o tijera en la preservación de biodiversidad.
La relevancia del modelo de piedra, papel o tijera en la preservación de biodiversidad
Thesis
Nieto C, Vargas C, Pedraza J, Singh A. (2024)
Mechanisms of cell size regulation in slow-growing Escherichia coli cells: discriminating models beyond the adder
npj Systems Biology and Applications (ISSN 20567189)
Article
Okumus B, Pedraza J, Bakshi S. (2023)
Editorial: Next-generation quantitative and synthetic biology: High-sensitivity, high-accuracy, and digital approaches
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (ISSN 22964185)
Article
.(2023). Modelo estocástico de la evolución fenotípica: Un acercamiento desde la teoría de juegos y el cálculo estocástico.
Modelo estocástico de la evolución fenotípica: Un acercamiento desde la teoría de juegos y el cálculo estocástico
Thesis
.(2023). Modelos estocásticos en la división de bacterias desde el énfasis teórico-computacional.
Modelos estocásticos en la división de bacterias desde el énfasis teórico-computacional
Thesis
.(2023). Producción de alcanos en E.coli usando fotoenzimas: Diseño y simulación de un plásmido de alta expresión..
Producción de alcanos en E.coli usando fotoenzimas: Diseño y simulación de un plásmido de alta expresión.
Thesis
.(2022). Modelamiento del primer módulo de quorum sensing de Pseudomonas aeruginosa.
Modelamiento del primer módulo de quorum sensing de Pseudomonas aeruginosa
Thesis
Escobar M, Jeanneret G, Bravo L, Castillo A, Gomez C, Valderrama D, ROA M, Martínez J, Madrid-wolff J, Cepeda M, Guevara-Suarez M, Sarmiento OL, Medaglia A, Forero-Shelton Manu, Velasco M, Pedraza J, Laajaj R, Restrepo S, Arbelaez P. (2022)
Smart pooling: AI-powered COVID-19 informative group testing
SCIENTIFIC REPORTS (ISSN 2045-2322)
Article
.(2021). Análisis de la propagación de ruido en redes genéticas retroalimentadas..
Análisis de la propagación de ruido en redes genéticas retroalimentadas.
Thesis
Nieto C, Vargas C, Pedraza J. (2021)
Continuous rate modeling of bacterial stochastic size dynamics
Physical Review E (ISSN 2470-0045)
Article
.(2021). Diseño de Control para un Toggle Switch alrededor de su inestabilidad.
Diseño de Control para un Toggle Switch alrededor de su inestabilidad
Thesis
.(2021). Group selection and altruistic behaviour in a plasmid-bacteria system, a probabilistic simulation.
Group selection and altruistic behaviour in a plasmid-bacteria system, a probabilistic simulation
Thesis
.(2021). Microscopio de hoja de luz con alta tasa de procesamiento de muestras.
Microscopio de hoja de luz con alta tasa de procesamiento de muestras
Thesis
.(2021). Modelo unificado de estrategias de control de división celular y dinámicas de ruido causadas por expresión genética.
Modelo unificado de estrategias de control de división celular y dinámicas de ruido causadas por expresión genética
Thesis
.(2021). Multilevel Selection in Escherichia coli Plasmids: a theoretical and experimental approach.
Multilevel Selection in Escherichia coli Plasmids: a theoretical and experimental approach
Thesis
Duran D, Hernandez C.A., Suesca E, Acevedo R, Acosta I, Forero D, Rozo F, Pedraza J. (2021)
Slipstreaming mother machine: A microfluidic device for single-cell dynamic imaging of yeast
Micromachines (ISSN 2072-666X)
Article
Betancourt PL, Guevara-Suarez M, Hidalgo M, Restrepo S, Potdevin E, Huertas J, Medaglia A, Pedraza J, Cepeda M, Arbelaez P. (2020)
El papel de la ingeniería en la pandemia de COVID-19
Revista de Ingeniería: Universidad de los Andes (ISSN 2011-0049)
Article
Nieto C, Arias J, Vargas C, Sanchez C, Pedraza J. (2020)
Correlation between protein concentration and bacterial cell size can reveal mechanisms of gene expression
Physical Biology (ISSN 14783967)
Article
Nieto C, Vargas C, Singh A, Pedraza J. (2020)
Division stochasticity can be transmitted to protein expression through chromosome replication
IFAC-PapersOnLine (ISSN 24058963)
Article
.(2019). ADOPCIÓN DE LA RESPONSABILIDAD DE MANDO EN EL ORDENAMIENTO JURÍDICO COLOMBIANO: tensiones entre el derecho internacional y nacional en justicia transicional.
ADOPCIÓN DE LA RESPONSABILIDAD DE MANDO EN EL ORDENAMIENTO JURÍDICO COLOMBIANO: tensiones entre el derecho internacional y nacional en justicia transicional
Thesis
Nieto C, Pedraza J. (2019)
Dissecting cell-size control strategies through stochastic processes
2019 IEEE 4th Colombian Conference on Automatic Control (CCAC) (ISBN 978-1-5386-6962-4)
Inproceeding
.(2019). EL CONTRATO DE CORRETAJE FRENTE AL CONSUMO DE VIVIENDA: PRECISIONES AL DEBER INFORMACION.
EL CONTRATO DE CORRETAJE FRENTE AL CONSUMO DE VIVIENDA: PRECISIONES AL DEBER INFORMACION
Thesis
Nieto C, Vargas C, Singh A, Pedraza J. (2019)
Efficient computation of stochastic cell-size transient dynamics
BMC Bioinformatics (ISSN 14712105)
Article
.(2019). Esa metafísica que no es Una. Materialismo inmanente, conocimientos corporizados y formas de vida posthumanas.
Esa metafísica que no es Una. Materialismo inmanente, conocimientos corporizados y formas de vida posthumanas
Thesis
.(2018). 1 Efecto de la aspersión aérea de cultivos ilícitos en trabajo infantil, asistencia y rezago escolar.
1 Efecto de la aspersión aérea de cultivos ilícitos en trabajo infantil, asistencia y rezago escolar
Thesis
.(2018). An Information Theoretic Perspective on the Neural Code.
An Information Theoretic Perspective on the Neural Code
Thesis
.(2018). Generación de una herramienta para la determinación del riesgo asociado al consumo de peces contaminados con mercurio y metilmercurio.
Generación de una herramienta para la determinación del riesgo asociado al consumo de peces contaminados con mercurio y metilmercurio
Thesis
.(2018). PROPUESTA PARA LA ADOPCIÓN DE POLÍTICAS DE BUEN GOBIERNO Y GOBIERNO CORPORATIVO EN LAS INSTITUCIONES DE EDUCACIÓN SUPERIOR PÚBLICAS.
PROPUESTA PARA LA ADOPCIÓN DE POLÍTICAS DE BUEN GOBIERNO Y GOBIERNO CORPORATIVO EN LAS INSTITUCIONES DE EDUCACIÓN SUPERIOR PÚBLICAS
Thesis
Pedraza J.
1st Latin-American Workshop and Conference on Systems Biology
Event
.(2017). Desde el Material.
Desde el Material
Thesis
.(2017). PHYSIOLOGY, EVOLUTION AND SINGLE CELL GENE EXPRESSION. An experimental approach using a microfluidics technique.
PHYSIOLOGY, EVOLUTION AND SINGLE CELL GENE EXPRESSION. An experimental approach using a microfluidics technique
Thesis
.(2017). Transmisión de información en la integración de múltiples señales enE.coli..
Transmisión de información en la integración de múltiples señales enE.coli.
Thesis
Moran R .(2016). Estadísticas y Ruido Intrínseco de la Expresión Genética.
Estadísticas y Ruido Intrínseco de la Expresión Genética
Thesis
Sanchez C .(2016). FITNESS MAXIMIZATION UNDER CONTROLLED ENVIRONMENTAL UNCERTAINTY.
FITNESS MAXIMIZATION UNDER CONTROLLED ENVIRONMENTAL UNCERTAINTY
Thesis
Pedraza J.
International workshop: “Stochastic processes with applications in the natural sciences”
Event
.(2016). Respuesta en fitness a cambios de un medio ambiente oscilante en el sistema GAL de Saccharomyces cerevisiae.
Respuesta en fitness a cambios de un medio ambiente oscilante en el sistema GAL de Saccharomyces cerevisiae
Thesis
Linares J .(2016). Soluciones analíticas a sistemas de expresión de genes con feedback negativo.
Soluciones analíticas a sistemas de expresión de genes con feedback negativo
Thesis
Quiroga V .(2016). Stochastic Models on Persistence.
Stochastic Models on Persistence
Thesis
Gutierrez L .(2016). Stochastic models of genetic circuits.
Stochastic models of genetic circuits
Thesis
.(2015). Metabolic Network Reconstruction of Manihot esculenta Crantz.
Metabolic Network Reconstruction of Manihot esculenta Crantz
Thesis
Vanegas M .(2015). Regulating lead bioremediation-related genes through a construct design.
Regulating lead bioremediation-related genes through a construct design
Thesis
Otero A .(2015). Sistema de interacción entre fenotipos cooperantes y desertores utilizando Saccharomyces cerevisiae.
Sistema de interacción entre fenotipos cooperantes y desertores utilizando Saccharomyces cerevisiae
Thesis
Karr J, Williams A, Zucker J, Raue A, Steiert B, Timmer J, Kreutz C, Wilkinson S, Allgood B, Bot B, Hoff B, Kellen M, Covert M, Stolovitzky G, Meyer P, Hu Y, Baron M, Bryson K, Barker B, Bogart E, Wang Y, Chandramohan D, Huang L, Zawack K, Shestov A, Makadia H, Decicco D, Yin A, Wang M, Li S, Swistak M, Cygan M, Kazakiewicz D, Kursa M, Korytkowski P, Plewczynski D, Yang J, Li Y, Tang H, Wang T, Liu Y, Xie Y, Xiao G, Bello J, Botero D, Cañas S, Castro J, Gomez F, Valdes I, Gonzalez L, Bernal A, Pedraza J, Restrepo S, Reyes A. (2015)
Summary of the DREAM8 Parameter Estimation Challenge: Toward Parameter Identification for Whole-Cell Models
PLoS Computational Biology (ISSN 1553-734X)
Article
Contreras L .(2015). THE PHENOMENON OF PERSISTENCE IN ESCHERICHIA COLI IN RESPONSE TO THERMAL SHOCK.
THE PHENOMENON OF PERSISTENCE IN ESCHERICHIA COLI IN RESPONSE TO THERMAL SHOCK
Thesis
Perez M .(2014). Gene Expression and Directed Information.
Gene Expression and Directed Information
Thesis
Cañas S, Restrepo S, Pedraza J. (2014)
Novel Protocol for Persister Cells Isolation
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Article
Restrepo J .(2014). OPTIMIZACION DE RESPUESTAS BIOLOGICAS EN LA TRANSCRIPCION DE GENES.
OPTIMIZACION DE RESPUESTAS BIOLOGICAS EN LA TRANSCRIPCION DE GENES
Thesis
Barajas A .(2013). Analisis de las caractersticas dispersivas de medios heterogeneos a partir de la coherencia.
Analisis de las caractersticas dispersivas de medios heterogeneos a partir de la coherencia
Thesis
Ortega O .(2013). Analysis of the evolution of human cooperation using evolutionary game theory.
Analysis of the evolution of human cooperation using evolutionary game theory
Thesis
Toprak E, Veres A, Yildiz S, Pedraza J, Chait R, Paulsson J, Kishony R. (2013)
Building a morbidostat: An automated continuous-culture device for studying bacterial drug resistance under dynamically sustained drug inhibition
Nature Protocols (ISSN 1754-2189)
Article
Cañas S .(2013). Novel protocol for persister cells isolation & Genomic and transcriptomic analysis of E. coli DS1 (hipQ): A model for type II persistence..
Novel protocol for persister cells isolation & Genomic and transcriptomic analysis of E. coli DS1 (hipQ): A model for type II persistence.
Thesis
Regino L .(2013). Random switching as an adaptive strategy in changing environments.
Random switching as an adaptive strategy in changing environments
Thesis
Cañas S, Restrepo S, Pedraza J.
Synthetic biology approach for bacterial GMOs population control; Bacterial “Alarm Clock” based on Toxin-Antitoxin (TA) stimuli-dependent differential induction
Event
Leidy C, Pedraza J. (2013)
Tuning the range and stability of multiple phenotypic states with coupled positive-negative feedback loops
Nature Communications (ISSN 2041-1723)
Article
Mahecha L .(2012). Effects of Gene Expression Noise on Phenotype and cooperate-defect Fitness.
Effects of Gene Expression Noise on Phenotype and cooperate-defect Fitness
Thesis
.(2012). Evolución de la cooperación y especialización en poblaciones con estructura espacial.
Evolución de la cooperación y especialización en poblaciones con estructura espacial
Thesis
Pedraza J, Paulsson J. (2008)
Effects of molecular memory and bursting on fluctuations in gene expression
Science (ISSN 0036-8075)
Article
Pedraza J, Paulsson J. (2007)
Random timing in signaling cascades
Molecular Systems Biology (ISSN 1744-4292)
Article
Chabot J, Pedraza J, Luitel P, Van A. (2007)
Stochastic gene expression out-of-steady-state in the cyanobacterial circadian clock
Nature (ISSN 0028-0836)
Article
Pedraza J. (2006)
Noise in gene regulatory networks
Complex Systems Science In Biomedicine (ISBN 978-0-387-30241-6)
Inbook
Mettetal J, Muzzey D, Pedraza J, Ozbudak E, Van A. (2006)
Predicting stochastic gene expression dynamics in single cells
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (ISSN 0027-8424)
Article
Pedraza J. (2005)
Noise propagation in gene networks
Science (ISSN 0036-8075)
Article
Binder P, Pedraza J. (2000)
Nonregular languages in the kicked rotor
Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids, and Related Interdisciplinary Topics (ISSN 1063-651X)
Article
Binder P, Pedraza J, Garzón C. (1999)
An invertibility paradox
American Journal of Physics (ISSN 0002-9505)
Article

Projects

  • 2011
    • STOCHASTICITY AND GROWTH EFFECTS ON BACTERIAL PERSISTENCE

      Duration: 36 months

      PR.3.2011.1513.jmpedraza