Okumus B, Pedraza J, Bakshi S, Pedraza J. (2023)
Editorial: Next-generation quantitative and synthetic biology: High-sensitivity, high-accuracy, and digital approaches
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (ISSN 2296-4185)
Artículo
Juan Manuel Pedraza Leal
Juan Manuel Pedraza Leal
jmpedraza @uniandes.edu.co
Profesor Asociado
Oficina: IP-404
Extensión: 5179
Departamento de Física
Perfil
Cursos Recientes
- 2023
PROYECTO FINAL
Primer Periodo
Licenciatura
FÍSICA BÁSICA 1
Primer Periodo
Licenciatura
Productos Recientes
Escobar M, Castillo A, Guevara-Suarez M, Sarmiento OL, Medaglia A, Forero-Shelton Manu, Velasco M, Pedraza J, Laajaj R, Restrepo S, Arbelaez P. (2022)
Smart pooling: AI-powered COVID-19 informative group testing
SCIENTIFIC REPORTS (ISSN 2045-2322)
Artículo
Proyectos Recientes
- 2011
- STOCHASTICITY AND GROWTH EFFECTS ON BACTERIAL PERSISTENCE
Duración: 36 meses
PR.3.2011.1513.jmpedraza
Cursos
- 2023
PROYECTO FINAL
Primer Periodo
Licenciatura
FÍSICA BÁSICA 1
Primer Periodo
Licenciatura
FÍSICA BÁSICA 1
Segundo Periodo
Licenciatura
BIOLOGIA DE SISTEMAS
Segundo Periodo
Licenciatura
BIOLOGÍA DE SISTEMAS
Segundo Periodo
Maestría
PROYECTO TEORICO COMPUTACIONAL
Segundo Periodo
Licenciatura
PROYECTO EXPERIMENTAL
Segundo Periodo
Licenciatura
PROYECTO FINAL
Segundo Periodo
Licenciatura
- 2022
- 2021
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- 2016
- 2015
- 2014
- 2013
Productos
Okumus B, Pedraza J, Bakshi S, Pedraza J. (2023)
Editorial: Next-generation quantitative and synthetic biology: High-sensitivity, high-accuracy, and digital approaches
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (ISSN 2296-4185)
Artículo
Escobar M, Castillo A, Guevara-Suarez M, Sarmiento OL, Medaglia A, Forero-Shelton Manu, Velasco M, Pedraza J, Laajaj R, Restrepo S, Arbelaez P. (2022)
Smart pooling: AI-powered COVID-19 informative group testing
SCIENTIFIC REPORTS (ISSN 2045-2322)
Artículo
Nieto C, Vargas C, Pedraza J. (2021)
Continuous rate modeling of bacterial stochastic size dynamics
Physical Review E (ISSN 2470-0045)
Artículo
Duran D, Hernandez C.A., Suesca E, Acevedo R, Acosta I, Forero D, Rozo F, Pedraza J. (2021)
Slipstreaming mother machine: A microfluidic device for single-cell dynamic imaging of yeast
Micromachines (ISSN 2072-666X)
Artículo
Betancourt PL, Guevara-Suarez M, Hidalgo M, Restrepo S, Potdevin E, Huertas J, Medaglia A, Pedraza J, Cepeda M, Arbelaez P. (2020)
El papel de la ingeniería en la pandemia de COVID-19
Revista de Ingeniería: Universidad de los Andes (ISSN 2011-0049)
Artículo
Nieto C, Arias J, Vargas C, Sanchez C, Pedraza J. (2020)
Correlation between protein concentration and bacterial cell size can reveal mechanisms of gene expression
Physical Biology (ISSN 14783967)
Artículo
Nieto C, Vargas C, Singh A, Pedraza J. (2020)
Division stochasticity can be transmitted to protein expression through chromosome replication
IFAC-PapersOnLine ()
Artículo
Nieto C, Pedraza J. (2019)
Dissecting cell-size control strategies through stochastic processes
2019 IEEE 4th Colombian Conference on Automatic Control (CCAC) (ISBN 978-1-5386-6962-4)
Capítulo en Memoria
Moran R .(2016). Estadísticas y Ruido Intrínseco de la Expresión Genética.
Estadísticas y Ruido Intrínseco de la Expresión Genética
Tesis
Sanchez C .(2016). FITNESS MAXIMIZATION UNDER CONTROLLED ENVIRONMENTAL UNCERTAINTY.
FITNESS MAXIMIZATION UNDER CONTROLLED ENVIRONMENTAL UNCERTAINTY
Tesis
Pedraza J.
International workshop: “Stochastic processes with applications in the natural sciences”
Evento
Estupiñan J .(2016). Respuesta en fitness a cambios de un medio ambiente oscilante en el sistema GAL de Saccharomyces cerevisiae.
Respuesta en fitness a cambios de un medio ambiente oscilante en el sistema GAL de Saccharomyces cerevisiae
Tesis
Linares J .(2016). Soluciones analíticas a sistemas de expresión de genes con feedback negativo.
Soluciones analíticas a sistemas de expresión de genes con feedback negativo
Tesis
Quiroga V .(2016). Stochastic Models on Persistence.
Stochastic Models on Persistence
Tesis
Gutierrez L .(2016). Stochastic models of genetic circuits.
Stochastic models of genetic circuits
Tesis
Vanegas M .(2015). Regulating lead bioremediation-related genes through a construct design.
Regulating lead bioremediation-related genes through a construct design
Tesis
Otero A .(2015). Sistema de interacción entre fenotipos cooperantes y desertores utilizando Saccharomyces cerevisiae.
Sistema de interacción entre fenotipos cooperantes y desertores utilizando Saccharomyces cerevisiae
Tesis
Karr J, Williams A, Zucker J, Raue A, Steiert B, Timmer J, Kreutz C, Wilkinson S, Allgood B, Bot B, Hoff B, Kellen M, Covert M, Stolovitzky G, Meyer P, Hu Y, Baron M, Bryson K, Barker B, Bogart E, Wang Y, Chandramohan D, Huang L, Zawack K, Shestov A, Makadia H, Decicco D, Yin A, Wang M, Li S, Swistak M, Cygan M, Kazakiewicz D, Kursa M, Korytkowski P, Plewczynski D, Yang J, Li Y, Tang H, Wang T, Liu Y, Xie Y, Xiao G, Bello J, Botero D, Cañas S, Castro J, Gomez F, Valdes I, Gonzalez L, Bernal A, Pedraza J, Restrepo S, Reyes A. (2015)
Summary of the DREAM8 Parameter Estimation Challenge: Toward Parameter Identification for Whole-Cell Models
PLoS Computational Biology (ISSN 1553-734X)
Artículo
Contreras L .(2015). THE PHENOMENON OF PERSISTENCE IN ESCHERICHIA COLI IN RESPONSE TO THERMAL SHOCK.
THE PHENOMENON OF PERSISTENCE IN ESCHERICHIA COLI IN RESPONSE TO THERMAL SHOCK
Tesis
Perez M .(2014). Gene Expression and Directed Information.
Gene Expression and Directed Information
Tesis
Cañas S, Restrepo S, Pedraza J. (2014)
Novel Protocol for Persister Cells Isolation
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Artículo
Restrepo J .(2014). OPTIMIZACION DE RESPUESTAS BIOLOGICAS EN LA TRANSCRIPCION DE GENES.
OPTIMIZACION DE RESPUESTAS BIOLOGICAS EN LA TRANSCRIPCION DE GENES
Tesis
Barajas A .(2013). Analisis de las caractersticas dispersivas de medios heterogeneos a partir de la coherencia.
Analisis de las caractersticas dispersivas de medios heterogeneos a partir de la coherencia
Tesis
Ortega O .(2013). Analysis of the evolution of human cooperation using evolutionary game theory.
Analysis of the evolution of human cooperation using evolutionary game theory
Tesis
Toprak E, Veres A, Yildiz S, Pedraza J, Chait R, Paulsson J, Kishony R. (2013)
Building a morbidostat: An automated continuous-culture device for studying bacterial drug resistance under dynamically sustained drug inhibition
Nature Protocols (ISSN 1754-2189)
Artículo
Cañas S .(2013). Novel protocol for persister cells isolation & Genomic and transcriptomic analysis of E. coli DS1 (hipQ): A model for type II persistence..
Novel protocol for persister cells isolation & Genomic and transcriptomic analysis of E. coli DS1 (hipQ): A model for type II persistence.
Tesis
Regino L .(2013). Random switching as an adaptive strategy in changing environments.
Random switching as an adaptive strategy in changing environments
Tesis
Cañas S, Restrepo S, Pedraza J.
Synthetic biology approach for bacterial GMOs population control; Bacterial “Alarm Clock” based on Toxin-Antitoxin (TA) stimuli-dependent differential induction
Evento
Leidy C, Pedraza J. (2013)
Tuning the range and stability of multiple phenotypic states with coupled positive-negative feedback loops
Nature Communications (ISSN 2041-1723)
Artículo
Mahecha L .(2012). Effects of Gene Expression Noise on Phenotype and cooperate-defect Fitness.
Effects of Gene Expression Noise on Phenotype and cooperate-defect Fitness
Tesis
Pedraza J, Paulsson J. (2008)
Effects of molecular memory and bursting on fluctuations in gene expression
Science (ISSN 0036-8075)
Artículo
Pedraza J, Paulsson J. (2007)
Random timing in signaling cascades
Molecular Systems Biology (ISSN 1744-4292)
Artículo
Chabot J, Pedraza J, Luitel P, Van A. (2007)
Stochastic gene expression out-of-steady-state in the cyanobacterial circadian clock
Nature (ISSN 0028-0836)
Artículo
Pedraza J. (2006)
Noise in gene regulatory networks
Complex Systems Science In Biomedicine (ISBN 978-0-387-30241-6)
Capítulo de Libro
Mettetal J, Muzzey D, Pedraza J, Ozbudak E, Van A. (2006)
Predicting stochastic gene expression dynamics in single cells
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (ISSN 0027-8424)
Artículo
Pedraza J. (2005)
Noise propagation in gene networks
Science (ISSN 0036-8075)
Artículo
Binder P, Pedraza J. (2000)
Nonregular languages in the kicked rotor
Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids, and Related Interdisciplinary Topics (ISSN 1063-651X)
Artículo
Binder P, Pedraza J, Garzón C. (1999)
An invertibility paradox
American Journal of Physics (ISSN 0002-9505)
Artículo
Proyectos
- 2011
- STOCHASTICITY AND GROWTH EFFECTS ON BACTERIAL PERSISTENCE
Duración: 36 meses
PR.3.2011.1513.jmpedraza